Do cố GS Hoàng Đình Cầu làm Chủ tịch Hội.
Theo Quyết định số 175/CT ngày 23/5/1990, do GSTS. NSND Đình Quang làm Chủ tịch Hội.
Sau khi nước Đức thống nhất, hai Hội hữu nghị của Việt Nam với Tây Đức và CHDC Đức sáp nhập thành Hội hữu nghị Việt Nam - Đức (gọi tắt là Hội hữu nghị Việt - Đức). Ngày 23/05/1985 được lấy làm ngày thành lập Hội.
Cố GS Hoàng Đình Cầu giữ chức Chủ tịch Hội.
GS.TS NSND Đình Quang, GS Trọng Bằng và GS.TSKH. Hoàng Văn Huây được bầu làm Phó Chủ tịch Hội.
Hội nghị Ban Chấp hành mở rộng bầu GS.TSKH Hoàng Văn Huây, Thứ trưởng Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường làm Chủ tịch Hội.
Giáo sư Đình Quang và Giáo sư Trọng Bằng tiếp tục đảm nhiệm cương vị Phó Chủ tịch Hội.
Tại Đại hội Đại biểu toàn quốc lần thứ III của Hội, GS.TSKH. Hoàng Văn Huây tiếp tục được bầu làm Chủ tịch.
Các ông Lê Kế Sơn, Phan Thanh Tịnh, Trần Quang Vũ và Lưu Quang Minh được bầu làm Phó Chủ tịch Hội.
Bà Phạm Thị Thái làm Tổng thư ký Hội.
Tháng 7/2009: Ban Chấp hành Hội khoá 2007-2013 bầu bổ sung đồng chí Chu Tuấn Cáp làm Phó Chủ tịch Hội, đồng thời miễn nhiệm chức Phó Chủ tịch Hội đối với đồng chí Trần Quang Vũ.
Ngày 03/11/2012, Đại hội Đại biểu toàn quốc lần thứ IV nhiệm kỳ 2012-2017 được tổ chức.
Đại hội bầu Ban Chấp hành Hội gồm 63 Uỷ viên.
Ông Vũ Huy Hoàng, Bộ trưởng Bộ Công thương, làm Chủ tịch Hội.
Các Phó Chủ tịch Hội gồm: ông Hoàng Văn Huây, ông Chu Tuấn Cáp, ông Phan Thanh Tịnh, bà Nguyễn Thuý Hiền, ông Mai Anh, và bà Phạm Thị Thái (Phó Chủ tịch kiêm Tổng Thư ký Hội).
Ban Thường vụ có 15 người, gồm Chủ tịch, sáu Phó Chủ tịch và tám Uỷ viên.
Ngày 04/8/2018, Hội tổ chức Đại hội Đại biểu toàn quốc lần thứ V nhiệm kỳ 2018-2023.
Đại hội bầu Ban Chấp hành Hội gồm 78 Ủy viên và Ban Kiểm tra gồm 3 Ủy viên.
Ông Nguyễn Chí Dũng, Bộ trưởng Bộ Kế hoạch và Đầu tư, được bầu làm Chủ tịch Hội nhiệm kỳ 2018-2023.
Ban Thường vụ Hội gồm 17 Ủy viên, trong đó có Chủ tịch, 07 Phó Chủ tịch và 09 Ủy viên Ban Thường vụ.
Các Phó Chủ tịch Hội gồm: ông Mai Anh, bà Nguyễn Thúy Hiền, ông Hoàng Văn Huây, ông Nguyễn Đức Kiên, bà Phạm Thị Thái, ông Lê Viết Thái, ông Nguyễn Toàn Thắng.
Hội hữu nghị Việt Nam – Đức (Hội) là tổ chức xã hội của công dân và tổ chức Việt Nam quan tâm hoặc có liên quan các hoạt động trong lĩnh vực đối ngoại nhân dân với Cộng hòa liên bang Đức.